Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp12Q6P5B0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp12Q6P5B0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms