Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms