Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf2Q64705 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms