Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2bQ64511 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms