Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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