Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vil1Q62468 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms