Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpd52Q62393 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpd52Q62393 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms