Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprrQ62132 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PtprrQ62132 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PtprrQ62132 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PtprrQ62132 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprrQ62132 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprrQ62132 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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