Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm1Q61937 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm1Q61937 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms