Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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