Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamb3Q61087 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamb3Q61087 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms