Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms