Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin1Q60865 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms