Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms