Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms