Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsr1Q5SWD9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms