Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms