Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms