Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grhl3Q5FWH3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grhl3Q5FWH3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms