Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms