Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms