Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Chsy3Q5DTK1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chsy3Q5DTK1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chsy3Q5DTK1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chsy3Q5DTK1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chsy3Q5DTK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chsy3Q5DTK1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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