Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms