Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Fam220aQ3ZN08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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