Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc114Q3UX62 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms