Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms