Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms