Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrch2Q3UMG5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrch2Q3UMG5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms