Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx27Q3UHD6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms