Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms