Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrrc28Q3TX51 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrrc28Q3TX51 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc28Q3TX51 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc28Q3TX51 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrc28Q3TX51 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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