Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt2Q3TTY5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt2Q3TTY5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt2Q3TTY5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms