Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms