Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms