Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms