Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp2Q06335 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms