Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms