Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox13Q04891 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms