Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms