Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms