Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msx2Q03358 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms