Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfiaQ02780 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms