Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlh1Q02576 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms