Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms