Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba1Q02053 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba1Q02053 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms