Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms