Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms