Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja5Q01231 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms