Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms