Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb1Q00420 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms